Она показала жестом, что звонить сейчас не стоит.

Показала is the past tense, singular, feminine form of показать.

Because the subject is она, the verb must match it in gender and number:

• он показал
• она показала
• оно показало
• они показали

So the -а ending tells you the subject is feminine singular.

Also, показать is perfective, so показала presents the action as completed: she made the gesture / gave the signal.

Because жестом is in the instrumental case.

Here the instrumental shows the means by which she communicated something:

• показала жестом = showed by means of a gesture
• compare: написал карандашом = wrote with a pencil

So жестом means something like with a gesture or by gesture.

If you used жест in the nominative, it would not fit this structure.

Что introduces a subordinate clause and means that.

So the structure is:

• Она показала жестом = she indicated by a gesture
• что звонить сейчас не стоит = that calling now is not advisable

It connects the gesture with the content of the message.

You can think of it as: she signaled that ...

In this sentence, что is the normal and natural choice.

Russian sometimes allows other ways to introduce the content, for example with a colon:

• Она показала жестом: звонить сейчас не стоит.

But with the sentence written as one regular complex sentence, что is what you expect.

So learners should treat показала жестом, что... as a standard pattern.

Because Russian often uses an impersonal construction for ideas like:

• it is necessary
• it is possible
• it is not allowed
• it is not worth it
• one should / should not

Here the pattern is:

• не стоит + infinitive

So:

• звонить сейчас не стоит

means something like calling now is not a good idea or one shouldn’t call now.

This is very common in Russian. Compare:

• не надо спешить
• нельзя курить
• можно войти

In this pattern, не стоит means something like:

• it’s not worth
• it’s not advisable
• better not
• one shouldn’t

It comes from стоить, which often means to cost or to be worth, but in this construction it has a softer advisory meaning.

So звонить сейчас не стоит is usually softer than:

• нельзя звонить сейчас = calling now is forbidden / not allowed
• не надо звонить сейчас = don’t call now

Не стоит often sounds like calm advice or a polite warning.

This is an aspect question.

• звонить = imperfective
• позвонить = perfective

With не стоит, both can be possible, but the nuance changes.

звонить

This presents the action more generally: calling now is not advisable.

позвонить

This would point more to making one complete call.

In this sentence, звонить sounds natural because the advice is general: now is not a good time for calling.

Russian often leaves that unstated when the context makes it clear.

So звонить сейчас не стоит can mean:

• you shouldn’t call now
• we shouldn’t call now
• he/she shouldn’t call now
• calling now is not advisable

If you want to specify the person, Russian can add a dative pronoun:

• вам сейчас звонить не стоит = you shouldn’t call now
• мне сейчас звонить не стоит = I shouldn’t call now
• ему сейчас звонить не стоит = he shouldn’t call now

So the person is simply understood from context unless it needs to be made explicit.

No, Russian word order is fairly flexible.

This order is natural and neutral, but other versions are possible:

• Сейчас звонить не стоит
• Не стоит сейчас звонить

The core meaning stays the same, but the emphasis can shift slightly.

For example:

• Сейчас звонить не стоит puts сейчас a bit more in focus
• Не стоит сейчас звонить puts the advisory phrase не стоит first

In your sentence, звонить сейчас не стоит sounds smooth and standard.

Because что звонить сейчас не стоит is a subordinate clause.

Russian normally uses a comma before что when it introduces a clause like this:

• Она показала жестом, что...

So the comma marks the boundary between:

• the main clause: Она показала жестом
• the subordinate clause: что звонить сейчас не стоит

This is standard Russian punctuation.