The whale swims in the ocean.

Porque el sujeto es the whale, que equivale a it y está en tercera persona singular.
En presente simple, los verbos normalmente llevan -s con he, she, it.

• I swim
• You swim
• We swim
• They swim
• He/She/It swims

Como the whale = it, se dice The whale swims.

The es el artículo definido en inglés. Se usa cuando hablamos de algo específico o de algo que el oyente puede identificar.

• the whale = la ballena
• the ocean = el océano

En esta oración, suena como si habláramos de una ballena específica o de la idea general de la ballena como animal dentro de un ejemplo.
Y the ocean se usa porque hablamos del océano como lugar conocido o identificable.

Sí, también es posible, pero cambia un poco la idea.

• The whale swims in the ocean = la ballena nada en el océano
• A whale swims in the ocean = una ballena nada en el océano

A whale introduce una ballena no específica.
The whale suena más específica o más definida.

Ambas son correctas, pero no expresan exactamente lo mismo.

Porque la ballena nada dentro del agua, no sobre la superficie.

• in the ocean = dentro del océano
• on the ocean = sobre el océano / en la superficie del océano

Como una ballena nada en el agua, lo natural es in the ocean.

Porque en inglés el orden más común es:

Sujeto + verbo + complemento

Aquí:

• The whale = sujeto
• swims = verbo
• in the ocean = complemento de lugar

En español el orden también puede ser parecido:
La ballena nada en el océano.

En inglés, el orden suele ser más fijo que en español.

Sí. Esa oración también es correcta, pero usa otro tiempo verbal.

• The whale swims in the ocean = presente simple
• The whale is swimming in the ocean = presente continuo

Diferencia general:

• presente simple: habla de hechos, hábitos, verdades generales o descripciones normales
• presente continuo: habla de una acción que está ocurriendo en este momento o alrededor de este momento

Ejemplo:

• Whales swim in the ocean. = hecho general
• The whale is swimming in the ocean right now. = está nadando ahora mismo

Porque en presente simple, con he, she, it, el verbo necesita -s.

The whale cuenta como it, así que:

• Correcto: The whale swims in the ocean
• Incorrecto: The whale swim in the ocean

La forma swim sin -s se usa con:

• I
• you
• we
• they

Si hablas de varias ballenas, el sujeto pasa a plural y el verbo ya no lleva -s.

• Singular: The whale swims in the ocean.
• Plural: The whales swim in the ocean.

Fíjate en dos cambios:

1. whale → whales
2. swims → swim

Eso pasa porque the whales ya no es tercera persona singular, sino plural.

Una guía aproximada para hispanohablantes sería:

• whale ≈ weil
• swims ≈ suimz
• ocean ≈ óu-shen

Algunos puntos importantes:

• whale empieza con sonido w, no con sonido de gü fuerte.
• En swims, la i es corta, y al final suele sonar como z: swimz.
• ocean tiene dos sílabas principales: O-cean, y la parte final suena como shen.

Swim es un verbo irregular en sus otras formas, aunque en presente simple funciona normalmente.

Formas principales:

• base form: swim
• present simple (he/she/it): swims
• past simple: swam
• past participle: swum

Ejemplos:

• The whale swims.
• The whale swam.
• The whale has swum.

En esta oración, normalmente no. Lo natural es:

The whale swims in the ocean.

Decir solo in ocean es incorrecto en inglés estándar.
Con sustantivos contables singulares, casi siempre necesitas un determinante como:

• the
• a/an
• this
• my, etc.

Como ocean aquí es singular y contable, necesita artículo:

• Correcto: in the ocean
• Incorrecto: in ocean

Puede entenderse de las dos maneras, pero por estar en presente simple, normalmente suena a:

• hecho general
• descripción
• verdad común
• hábito o comportamiento típico

Por eso The whale swims in the ocean se interpreta más como una descripción general que como una acción que estamos viendo justo ahora.

Si quieres enfatizar que está ocurriendo en este momento, lo más natural sería:

The whale is swimming in the ocean.