The windowsill has indirect light.

Porque el sujeto es The windowsill, que es tercera persona singular.
En presente simple:

• I/you/we/they have
• he/she/it has

Aquí windowsill es una sola cosa, así que va con has.

The se usa cuando hablamos de algo específico o conocido en el contexto.
Por ejemplo, puede ser el alféizar de esa ventana en particular.

• The windowsill = un alféizar específico
• A windowsill = cualquier alféizar, uno no específico

Si estuvieras describiendo una habitación en general, también podrías oír A windowsill gets indirect light, pero cambia un poco la idea.

Porque en esta oración has expresa que el alféizar cuenta con o recibe ese tipo de luz.
No está describiendo lo que es, sino una condición o característica que tiene.

Compara:

• The windowsill has indirect light. = el alféizar tiene/recibe luz indirecta
• The windowsill is indirect light. = esto no tiene sentido en inglés

Sí, se entiende y es bastante natural, especialmente en contextos como plantas, decoración o fotografía.
Aun así, en inglés de uso cotidiano también son muy comunes estas opciones:

• The windowsill gets indirect light.
• There is indirect light on the windowsill.
• The windowsill receives indirect light.

Gets suele sonar más conversacional.
Receives suena un poco más formal.
Has suena simple y claro.

Porque light aquí es un sustantivo incontable.
Cuando hablamos de la luz en general, normalmente no usamos a/an.

Correcto:

• indirect light
• natural light
• bright light

Incorrecto en este contexto:

• an indirect light

Solo usarías a light cuando light significa lámpara o foco, no luz como iluminación.

Se refiere a luz que no pega de forma directa.
Por ejemplo, luz que entra por una ventana pero no cae con rayos directos del sol sobre ese lugar.

En inglés, esta expresión es muy común en temas de:

• plantas
• interiores
• fotografía
• cuidado del hogar

También existe direct light como contraste.

Sí, a veces sí. Pero no siempre significan exactamente lo mismo.

• indirect light = luz indirecta en general
• indirect sunlight = específicamente luz solar indirecta

Si el contexto ya es una ventana o plantas, muchas veces indirect light basta y suena muy natural.
Si quieres enfatizar que viene del sol, indirect sunlight también funciona.

Normalmente se pronuncia algo como:

WIN-doh-sil

Puntos importantes:

• window suena como WIN-doh
• sill rima con hill

La pronunciación aproximada en IPA es:

/ˈwɪn.doʊ.sɪl/

Un error común es separarla demasiado como si fueran dos palabras muy marcadas. En habla normal suena bastante fluido: windowsill.

Hoy en día, windowsill escrito junto es muy común y totalmente correcto.
A veces también verás window sill separado, y puede aparecer en algunos textos, pero windowsill es la forma más estándar en muchos contextos actuales.

Si estás aprendiendo inglés, lo más seguro es usar:

windowsill

Sí, y de hecho es muy común.
Por ejemplo:

• There is indirect light on the windowsill.
• The plant on the windowsill gets indirect light.

Windowsill es el lugar físico, y con on the windowsill indicas que algo está sobre ese alféizar.

Muy frecuentemente en inglés se diría algo como:

• This plant does well in indirect light.
• Keep the plant on a windowsill with indirect light.
• The plant gets indirect light on the windowsill.

O sea, cuando el foco es la planta, muchas veces el inglés prefiere hablar de la planta como sujeto, no del alféizar.

Aquí significa luz como iluminación.
No significa lámpara.

En inglés, light puede significar dos cosas:

• luz → como en natural light, bright light, indirect light
• lámpara/foco → como en Turn on the light

En esta oración, por el adjetivo indirect, claramente significa iluminación.