The squirrel sits in the tree.

Porque en inglés el artículo definido the se usa delante de cada sustantivo cuando ambos son específicos.

• the squirrel = una ardilla específica
• the tree = un árbol específico

En español muchas veces no repetimos la idea de la misma forma, pero en inglés sí es normal.
No se dice The squirrel sits in tree porque tree necesita artículo o algún determinante, por ejemplo:

• the tree
• a tree
• my tree
• that tree

Porque el sujeto es the squirrel, que equivale a it y es tercera persona singular.

En presente simple, con he / she / it, el verbo normalmente lleva -s:

• I sit
• You sit
• We sit
• They sit
• He sits
• She sits
• It sits

Como the squirrel = it, entonces usamos sits.

No siempre. Sit muchas veces sí significa sentarse, pero en una oración como esta suele expresar estar posado, estar sentado o estar colocado en cierta posición.

Con animales, sits puede sonar más natural como:

• está posada
• está sentada
• permanece en esa posición

O sea, no necesariamente imaginas a la ardilla “sentándose” en ese momento, sino estando en esa posición.

Porque in the tree normalmente significa que algo está entre las ramas, hojas o dentro de la estructura del árbol. Es la opción más natural para un animal como una ardilla o un pájaro.

• The squirrel is in the tree. = la ardilla está en el árbol, entre sus ramas
• on the tree suena menos natural para este caso

On the tree se usa más para cosas sobre la superficie del árbol, por ejemplo:

• There is moss on the tree.
• There are decorations on the tree.

Entonces, para una ardilla, in the tree es lo normal.

Sí, totalmente.

Las dos opciones son correctas, pero tienen matices:

• The squirrel sits in the tree.
  Puede sonar como una descripción general, un hecho, o una narración simple.
• The squirrel is sitting in the tree.
  Enfatiza que la acción está ocurriendo ahora mismo.

En inglés hablado, si estás describiendo lo que ves en este momento, muchas veces sonará más natural:

• The squirrel is sitting in the tree.

Sí, squirrel es una palabra difícil para muchos estudiantes.

Pronunciación aproximada en inglés de EE. UU.: /ˈskwɝːəl/

Una ayuda aproximada para hispanohablantes podría ser algo como:

• skwér-rel
• o skwír-rel (aproximación, no exacta)

Puntos importantes:

• empieza con squ- = un sonido como sku/ skw
• la rr en inglés no suena como la rr fuerte del español
• la última sílaba suele sonar débil, algo como -əl

Lo mejor es practicarla por partes:

1. squir-
2. -rel
3. squirrel

En esta oración, the normalmente suena como thə /ðə/ porque va antes de una consonante:

• the squirrel
• the tree

Regla útil:

• the
  • sonido consonante → /ðə/
• the
  • sonido vocálico → /ði/

Ejemplos:

• the squirrel → /ðə .../
• the apple → /ði .../

Además, el sonido th de the no existe igual en español. Se hace poniendo la lengua suavemente entre los dientes y dejando salir el aire con voz.

Porque el orden más normal en inglés es:

Sujeto + verbo + complemento

Aquí:

• The squirrel = sujeto
• sits = verbo
• in the tree = complemento de lugar

En español el orden puede moverse más:

• La ardilla se sienta en el árbol
• En el árbol se sienta la ardilla

Pero en inglés normalmente se mantiene el orden básico:

• The squirrel sits in the tree.

No en inglés normal.

Los sustantivos contables singulares casi siempre necesitan un determinante, por ejemplo:

• a squirrel
• the squirrel
• my squirrel
• that squirrel

Por eso Squirrel sits in the tree suena incorrecto.

Las formas correctas serían:

• The squirrel sits in the tree.
• A squirrel sits in the tree.

La diferencia es específico vs. no específico.

• the squirrel = una ardilla específica, conocida o identificable
• a squirrel = cualquier ardilla, una ardilla no específica

Ejemplos:

• The squirrel sits in the tree.
  Hablas de una ardilla en particular.
• A squirrel sits in a tree.
  Hablas de una ardilla cualquiera y de un árbol cualquiera.

No, porque el sujeto ya está expreso: The squirrel.

En inglés siempre se necesita sujeto, pero aquí el sujeto ya aparece completo.

• Correcto: The squirrel sits in the tree.
• Incorrecto: The squirrel it sits in the tree.

Solo usarías it si reemplazas the squirrel:

• It sits in the tree.

Porque esa estructura reflexiva del español no se copia igual en inglés.

En español decimos muchas veces:

• La ardilla se sienta...

Pero en inglés simplemente usamos el verbo:

• The squirrel sits...

No necesitas un equivalente de se aquí.
En este caso, sit no lleva pronombre reflexivo.

Sí, suena correcta y natural.

Aun así, dependiendo del contexto, un hablante también podría decir:

• The squirrel is in the tree.
• The squirrel is sitting in the tree.

La versión con sits es gramatical y buena, especialmente para:

• descripciones simples
• narración
• ejemplos de gramática
• observaciones generales

Así que la oración está bien tal como está.